シフトの休憩時間を登録したい場合は、1日の勤務時間内にシフトパターンを2つ設定し、休憩時間を空き状態にしてください。
 

【スタッフ・シフト＞シフトパターン設定＞シフトパターン登録＞休憩前の勤務時間を登録＞追加＞休憩後の勤務時間を登録】